ВЫДЕЛЕНИЕ И ОЧИСТКА МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ
Исследование структурно-функционального состояния мембранных белков осуществляют после проведения двух важнейших этапов:
— выделения и очистки определенного белка;
— анализа полученной фракции для определения ее чистоты и исследования структуры чистого компонента.
В разделе 5.2. были охарактеризованы методы выделения мембранных структур, которые широко используются и для получения мембранных белков. Поэтому остановимся на некоторых вопросах, касающихся очистки интегральных мембранных белков с применением детергентов.
Детергенты — это группа амфифильных соединений, которые способны связываться с гидрофобными участками мембранных белков, контактирующими с липидной фазой мембран, тем самым разрушая ее структуру. В ходе солюбилизации мембран детергентами последние модифицируют бислой липидов, разрыхляя его, затем образуют смешанные (белок-липид-детергентные) мицеллы, а в конечном итоге — детергент-белковые и липид- детергентные мицеллы. Для сохранения мембранных белков в растворимом состоянии необходимо постоянное присутствие детергента. Его удаление приводит к агрегации и последующему осаждению молекул белка.
Основной проблемой очистки белков является подбор детергента и оптимальных условий солюбилизации их молекул. Детергент не должен нарушать высшие типы пространственной организации белков, а лишь замещать молекулы липидов, контактирующие с гидрофобными участками белковой глобулы. Критерий максимальной солюбилизации белка — переход его молекул в надосадочную жидкость после осаждения мембран. Причем важным требованием процедуры солюбилизации является сохранение функциональной активности биополимера и его стабилизация. Для этого в исследуемую систему добавляют экзогенные фосфолипиды, глицерин, ингибиторы протеаз. Следует отметить, что получаемые при очистке белок- детергентные комплексы могут содержать значительные количества связанных фосфолипидов, что необходимо учитывать при дальнейшем разделении и характеристике получаемого препарата белка.
При выборе детергента необходимо учитывать:
1) критическую концентрацию мицеллообразования и размер мицелл детергента;
2) заряд детергента;
3) возможность осаждения при определенном значении pH;
4) возможность светопоглощения в диапазоне длин волн, используемом при определении концентрации белка оптическим методом (при 280 нм).
Если концентрация детергента превышает критическую концентрацию мицеллообразования, то детергент полностью солюбилизирует мембранные структуры. В противоположном случае (концентрация меньше ККМ) детергент модифицирует мембрану, не разрушая полностью липидный бислой. Кроме того, необходимо учитывать зависимость этого параметра от температуры и ионной силы среды. Детергенты с низкой ККМ, образующие крупные мицеллы, вследствие низкой концентрации мономеров не способны полностью удаляться при диализе или ультрафильтрации, что может привести к денатурации белка при накоплении молекул детергента. Поэтому удобнее пользоваться детергентами с высокими значениями ККМ (цвиттерионные детергенты, соли желчных кислот, октилглю- козид). Еще одной характеристикой детергента является его агрегационное число. Это количество молекул, входящих в состав одной мицеллы. Детергенты с высоким агрегационным числом образуют выраженные мицеллярные структуры, которые внедряются в липидный бислой и солюбилизируют его. Детергенты с низким агрегационным числом не способны образовывать собственные мицеллы и лишь встраиваются в бислой липидов.
Выбор детергента для выделения и очистки определенного мембранного белка осуществляется методом проб и ошибок, однако исследователи стремятся к использованию минимальных концентраций детергента с целью сохранения нативного структурно-функционального состояния изучаемого белка. Наиболее эффективными считают неионные детергенты (тритон Х-100, ок- тилглюкозид), соли желчных кислот (холат, дезоксихолат), цвиттерионные детергенты.
На рис. 60 приведены структурные формулы, а в табл. 18 описаны свойства некоторых детергентов, используемых для выделения и очистки мембранных белков.
Необходимо отметить, что свойства растворов солей желчных кислот существенно зависят от температуры, pH, ионной силы. Эти соединения способны к образованию гелей при сдвиге pH на единицу выше рКа (для холата — 5,2, для дезоксихолата — 6,2).
Рис. 60. Структурные формулы некоторых детергентов, используе мых в мембранологии
Таблица 18
Свойства некоторых детергентов
| Детергенты | ккм, ммоль/л | Молеку лярная масса | Размер мицелл | Агрега ционное число | Удельный объем, мл/г |
| Додецилсульфат натрия (анионный детергент) | 1,33 | 288 | 24500 | 85 | 0,864 |
| Холат натрия (0,15 ммоль/л NaCl, 20 ’С, pH 9,0) | 3 | 408 | 2100 | 5 | 0,778 |
| Дезоксихолат натрия (0,15 ммоль/л NaCl, 20 *С, pH 9,0) | 0,91 | 392 | 2300 | 55 | 0,771 |
| Тритон Х-100 (незаряженный детергент)* | 0,24 | 628 | 90000 | 140 | 0,908 |
| Твин 80 (незаряженный детергент)* | 0,012 | 1300 | 76000 | 60 | 0,896 |
| P-D-ОВТИЛГЛІОКОЗИД (незаряженный детергент) | 25 | 293 | 8000 | 27 | 0,820 |
| Лаурилдиметиламиноксид (цвиттерионный детергент) | 2,2 | 229 | 17000 | 75 | 1,112 |
| Цвиттергент 3—12 (цвиттерионный детергент) | 3,6 | 335 | — | — | 0,957 |
* Полидисперсная смесь, приведены средние значения.
5.5.
Еще по теме ВЫДЕЛЕНИЕ И ОЧИСТКА МЕМБРАННЫХ БЕЛКОВ:
- 1.2.1. Классификация, структура и функции мембранных белков
- 3.3.1. Модификация методики выделения и очистки ДНК малины и ежевики
- Изменения белков
- Деструкция белков
- Денатурация белков
- Цитоскелет (мембранный каркас)
- Неравновесные состояния белков и их релаксация
- Соединение уголовных дел, выделение уголовного дела, выделение в отдельное производство материалов уголовного дела
- Очистка вентиляционного воздуха.
- Б. Контроль качества предстерилизационной очистки эндоскопов.
- VIII. Предстерилизационная очистка эндоскопов
- VI. Очистка эндоскопов
- Особенности структуры и функций мембранных рецепторов
- Плазматическая мембрана