Особенности экспрессии генов системы AP-1 у пациентов с очаговой склеродермией
В настоящем разделе приведены результаты определения экспрессии генов системы AP-1 у больных очаговой склеродермией с помощью количественной методики ПЦР с детекцией продуктов амплификации «в режиме реального времени».
В исследование были включены 20 образцов кожи, полученные из склеродермических очагов путем пункционной биопсии. В качестве контроля использовались образцы кожи тех же пациентов, взятые на расстоянии 3 см от патологического очага в пределах непораженной ткани. Большой интерес представляло сравнение уровней экспрессии генов в пораженной части кожи больных склеродермией по отношению к визуально непораженной части кожи. Такое сравнение, принятое и в ряде зарубежных лабораторий, позволяет максимально исключить влияние побочных факторов на чистоту эксперимента [Kulski et al., 2005].Проанализировав ряд статей и баз данных, был сделан вывод, что в исследованных процессах, играющих важную роль в развитии склеродермии, в к ач е с т в е о с н о в н ы х т р а н с к р и п ц и о н н ы х ф а к т о р о в п р и с у т с т ву ю т преимущественно компоненты фактора АР-1. Компоненты транскрипционного комплекса AP-1 могут являться генами-кандидатами при склеродермии по следующим причинам. Известно, что транскрипционный фактор AP-1 представляет собой группу парных комплексов, образованных ДНК- связывающими белками, входящими в семейства Jun, Fos и ATF (Activating transcription factor). Фактор AP-1 обеспечивает ответ клеток на действие ростовых факторов, цитокинов, нейротрансмиттеров и других межклеточных сигнальных молекул. В регуляции активности AP-1 участвуют G-белки, адаптерные белки, MAP-киназы и другие компоненты внутриклеточных регуляторных систем [Турпаев К.Т. и др., 2006]. Транскрипционный фактор АР-1 участвует в поддержании базального уровня экспрессии многих генов. Он является одной из главных мишеней для индукции коллагена 1 типа [Cho et al.,
2006].
Его функции тесно связаны с процессами пролиферации и трансформации клеток. Индукция клеточной дифференцировки вызывает активацию транскрипции генов, кодирующих компоненты комплекса АР-1 [Турпаев К.Т. и др., 2006]. Классический фактор АР1, состоящий из белков Jun и Fos, узнает консенсусную последовательность TGACTCA, встречающуюся в промоторах множества генов.Был произведен анализ экспрессии следующих генов, кодирующих транскрипционный фактор АР-1: C-JUN, JUNB, JUND, C-FOS, FOSB, FRA-1, FRA-2, а также ATF-1, ATF-3 и ATF-4. Для анализа экспрессии данных генов определялись уровни мРНК соответствующих транскрипционных факторов в биоптатах кожи у пациентов с очаговой склеродермией.
При индивидуальном анализе каждого больного было показано, что уровень экспрессии гена C-FOS в пораженной склеродермией коже повышен относительно визуально не пораженной кожи (контроль) в интервале от 1,1 раз (больной 5) до 9.7 раз (больной 3). Минимальное изменение экспрессии гена отмечалось у больного с единичной бляшкой на стадии склероза, расположенной на коже спины. Максимальное увеличение экспрессии отмечалось у больного с несколькими бляшками, расположенными, однако в пределах одной анатомической области, в количестве 3. Взаимосвязь между степенью увеличения уровня экспрессии гена и распространенностью процесса отсутствовала (табл.9). Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3.9±2.65 раз (рис.2). У пациентов 5 и 8 изменение экспрессии в пораженной коже достоверно не отличается от экспрессии в непораженной коже.
Таблица 9 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена с-Fos в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 2.36 | 1.46 | 9.71 | 4.05 | 1.1 | 4.36 | 7.4 | 1.25 | 3.4 | 1.44 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | 6.27 | 1.21 | 2.24 | 8.9 | 5.68 | 1.24 | 2.68 | 6.3 | 4.27 | 3.09 |
Рис.2.
Уровень содержания мРНК гена C-FOS в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1Уровень экспрессии гена C-JUN в пораженной склеродермией коже повышен относительно визуально непораженной кожи (контроль) в интервале от 1.2 раз (больной 20) до 7.64 раз (больная 15, фотография 8). И минимальное, и максимальное увеличение показателей экспрессии генов наблюдалось у пациентов с бляшечной склеродермией с очагами на стадии эритематозных пятен, при этом отсутствовала зависимость от степени увеличения экспрессии и распространенности процесса (табл.10).
Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3.6±1.76 раза (рисунок 3).
Таблица 10 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена с-Jun в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 2.21 | 3.4 4 | 1.44 | 6.34 | 4.38 | 4.9 | 5.3 | 4.73 | 1.72 | 2.08 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | 4.37 | 1.5 1 | 1.95 | 4.69 | 7.64 | 3.29 | 2.932 | 4.22 | 4.16 | 1.2 |
Фотография 8.
Пациентка с бляшечной формой очаговой склеродермии, у которой отмечалось максимальное увеличение экспрессии гена с-Jun в очагах
Рис.3. Уровень содержания мРНК гена C-JUN в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
При измерении уровня экспрессии гена FRA-1 в пораженной склеродермией коже относительно визуально непораженной кожи было показано понижение в интервале от -1,78 раз (больной 11) до -11,8 раз (больная 13).
Максимальное уменьшение экспрессии гена отмечалась у пациентки с генера лизованной формой очаговой склеродермии и обширными эритематозными очагами на стадии индурации (фотография 9).
Фотография 9. Пациетка с генерализованной формой очаговой склеродермии, у которой отмечалось максимальной снижение экспрессии гена Fra-1
Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось пониженным в 4,16±2,7раза (рис.4).
Рис.4. Уровень содержания мРНК гена FRA-1 в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
В тоже время не отмечалось достоверной зависимости между степенью распространенности процесса и уровнем понижения экспрессии гена. Максимальные уровни экспрессии наблюдались как в случаях с ограниченными очагами, так и при распространенном процессе. У пациента 3 изменение экспрессии в пораженной коже достоверно не отличалось от экспрессии в непораженной коже.
В таблице 11 представлены сводные данные распределения показателя степени изменения экспрессии гена FRA-1 в зависимости от различных клинических форм.
Таблица 11 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена FRA-1 в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | -0.18 | -0.097 | -0.48 | -0.51 | -0.11 | -0.24 | -0.176 | -0.231 | -0.147 | -0.131 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | -0.56 2 | -0.19 | -0.09 | -0.26 | -0.18 5 | -0.19 3 | -0.14 | -0.556 | -0.161 | -0.16 |
Уровень экспрессии гена JUNB в пораженной склеродермией коже был повышен относительно визуально непораженной кожи в интервале от 1,09 раз (больной 20) до 7,5 раз (больная 7, фотография 10).
Интересно, что ма кс и ма л ь н о е и зм е н е н и е э кс п р е с с и и от м еч а л о с ь у п а ц и е н то в с генерализованной формой очаговой склеродермии, минимальное снижение экспрессии отмечалось у больного с бляшечной формой склеродермии, однако достоверная зависимость от распространенности процесса для данного гена также отсутствовала. Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3,96±2,04 раза (рис.5). Обощенные данные распределения показателя степени изменения экспрессии гена JunB в зависимости от различных клинических форм представлены в таблице 12.
Фотография 10. Пациентка с генерализованной формой очаговой склеродермии, у которой отмечалось достоверное увеличение экспрессии гена JunB
Рис.5. Уровень содержания мРНК гена JUNB в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
Таблица 12 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена JunB в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 3.92 | 2.08 | 4.47 | 7.13 | 2.11 | 2.075 | 7.48 | 4.33 | 4.87 | 3.95 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | 6.54 | 2.54 | 1.75 | 5.48 | 3.9 | 2.77 | 2.69 | 5.97 | 4.12 | 1.09 |
Уровень экспрессии гена JUN-D в пораженной склеродермией коже повышен относительно визуально непораженной кожи в интервале от 1,46 раз (больной 20) до 8,39 раз (больная 18).
Максимальное увеличение экспрессии гена отмечалось у пациентов с генерализованной формой на стадии локального отека, минимальное у больного с бляшечной склеродермией. Однако в целом в группе отсутствовала корреляция между клинической формой и степенью экспрессии гена.
Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 4,3±2,3 раза (рисунок 6).
Рис.6. Уровень содержания мРНК гена JUN-D в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
Таблица 13 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена JunD в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 7.64 | 5.3 | 1.82 | 2.28 | 6.36 | 3.97 | 8.26 | 3.23 | 3.09 | 1.63 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | 7.67 | 1.65 | 2.46 | 3.89 | 4.7 | 3.52 | 5.04 | 8.4 | 3.39 | 1.46 |
Изменение уровня экспрессии гена FRA-2 в пораженной склеродермией коже повышен относительно визуально непораженной кожи в интервале от 1,30
раз (больной 9) до 7,53 раз (больной 11). Максимальное изменение экспрессии отмечалось у пациента с бляшкой в стадии склерозирования. Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3,37±1,86 раза (рисунок 7). У пациента 9 изменение экспрессии в пораженной коже достоверно не отличается от экспрессии в непораженной коже.
Рис.7. Уровень содержания мРНК гена FRA-2 в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
Обощенные результаты исследования по распределению показателя степени изменения экспрессии гена Fra-2 в зависимости от различных клинических форм представлены в таблице 14.
При сопоставлении уровней экспрессии гена и распространенностью процесса не удалось выявить достоверной связи между ними. Максимальные значения отмечались чаще у больных с ограниченными формами.
Таблица 14 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена Fra-2 в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 3.58 | 6.16 | 1.83 | 6.04 | 6.05 | 6.72 | 4.12 | 2.63 | 1.67 | 3.66 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | 7.53 | 3.1 | 1.35 | 4.39 | 3.2 | 2.64 | 1.31 | 5.85 | 3.67 | 1.83 |
При измерении уровня экспре ссии гена FOSB в пораженной склеродермией коже относительно визуально непораженной кожи было показано повышение в интервале от 1,52 раз (больной 20) до 7,00 раз (больные
5 и 10). Максимальные изменения отмечались у пациентов с очаговой склеродермией на разных стадиях формирования бляшек: стадия локального отека и индурации. Также у обоих пациентов отмечалась разная распространенность процесса: у больного 5 отмечалась единичная бляшка, в то время, как у больной 10 процесс носил генерализованный характер с вовлечением кожи туловища и конечностей (фотография 11). Достоверная зависимость увеличения экспрессии гена от клинической картины данного заболевания отсутствовала. Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3,48±1,73 раза (рисунок 8).
Фотография 11. Пациентка с генерализованной формой очаговой склеродермии, у которой достоверно отмечалось максимальное увеличение экспрессии гена FOSB
Рис.8. Уровень содержания мРНК гена FOSB в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
Сводные данные распределения показателя степени изменения экспрессии гена FosB в зависимости от различных клинических форм представлены в таблице 15
Таблица 15 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена FosB в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 1.8 | 2.45 | 2.39 | 1.88 | 6.92 | 3.98 | 2.78 | 3.43 | 3.88 | 6.9 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Б |
| степень изменения экспрессии | 4,27 | 1,76 | 1,71 | 5,4 | 4,4 | 3,08 | 5,96 | 1,6 | 3,54 | 1,51 |
При индивидуальном анализе каждого клинического случая было показано, что уровень экспрессии гена ATF1 в пораженной склеродермией коже повышен относительно визуально непораженной кожи (контроль) в интервале от 1,1 раз (больной 8) до 5,4 раз (больная 14).
Максимальный уровень экспрессии отмечался у пациентки с бляшечной формой склеродермии, хотя зависимости между распространенностью процесса и степенью экспрессии, как и в других случаях, не отмечалось. Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3,19±1,4 раза (рисунок 9).
У пациентов 8 и 9 изменение экспрессии в пораженной коже достоверно не отличается от экспрессии в не пораженной коже.
Рис.9. Уровень содержания мРНК гена ATF1 в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
В таблице 16 представлены обобщенные данные показателя степени изменения экспрессии гена ATF-1 в зависимости от различных клинических форм.
Таблица 16 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена ATF-1 в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 3.3 | 4.8 | 2.18 | 4.02 | 4.74 | 3.02 | 4.12 | 1.07 | 1.11 | 2.44 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Г |
| степень изменения экспрессии | 3.6 | 4.63 | 1.3 | 5.4 | 3.98 | 4.8 | 2.05 | 1.65 | 3.8 | 1.67 |
Уровень экспрессии гена ATF3 в пораженной склеродермией коже повышен относительно визуально непораженной кожи (контроль) в интервале от 1.13 раз (больной 12) до 8 раз (больной 2). Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 3,9±2,17 раза (рисунок 10).
Рис.10. Уровень содержания мРНК гена ATF3 в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1
Сводные данные показателя степени изменения экспрессии гена ATF-3 в зависимости от распространенности процесса приведены в таблице 17.
Сопоставление уровней экспрессии генов и клинических форм не выявило достоверной связи между распространенностью процесса и максимумами экспрессии гена. Наблюдался разброс в максимальных значениях показателя в группе исследуемых больных.
Таблица 17 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена ATF-3 в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 6.63 | 7.93 | 3.74 | 4.25 | 6.62 | 2.42 | 6.44 | 2.14 | 1.94 | 2.85 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Г |
| степень изменения экспрессии | 7.38 | 1.12 | 2.4 | 5.89 | 2.5 | 2.1 | 4.5 | 3.9 | 1.64 | 1.66 |
При измерении уровня экспрессии гена ATF4 в пораженной склеродермией коже относительно визуально непораженной кожи было показано повышение в интервале от 1,14 раз (больной 8) до 10 раз (больной 11). Среднее значение изменения уровня экспрессии гена оказалось повышенным в 4,58±3 раза (рисунок 11). Таким образом, изменение экспрессии данного гена было максимальным по сравнению с другими генами системы AP-1, в то же время для данного гена также сохранялась тенденция отсутствия зависимости изменения экспрессии от степени распространенности процесса. У пациента 8 изменение экспрессии в пораженной коже достоверно не отличается от экспрессии в не пораженной коже.
В таблице 18 представлены общие данные по распределению показателя степени изменения экспрессии гена ATF-4 в зависимости от различных клинических форм.
Таблица 18 Распределение показателя степени изменения экспрессии гена ATF-4 в зависимости от различных клинических форм (Б-бляшечная, Г-
генерализованная)
| номер пробы | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
| форма заболевания | Б | Г | Б | Б | Б | Б | Г | Б | Г | Б |
| степень изменения экспрессии | 4.96 | 1.32 | 1.46 | 8.75 | 2.52 | 9.27 | 8.92 | 1.14 | 2.54 | 5.49 |
| номер пробы | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
| форма заболевания | Б | Б | Г | Б | Б | Б | Г | Г | Б | Г |
| степень изменения экспрессии | 9.93 | 4.03 | 1.61 | 5.37 | 3.32 | 3.96 | 1.32 | 7.98 | 5.61 | 2 |
Рис.11. Уровень содержания мРНК гена ATF4 в пораженной коже пациентов по отношению к уровню содержания в визуально непораженной склеродермией коже, принятому за 1