СПЕКТРОФОТОМЕТРИЧЕСКОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
Растение является довольно трудным объектом для исследования нуклеиновых кислот, тем не менее в настоящее время имеется немало методов их количественного определения в различных тканях, которые позволяют определять РНК и ДНК в одной навеске [1].
Определение фосфора РНК и ДНК ведется на спектрофотометре при длине волн 270 и 290 нм в свежем или фиксированном материале. Фиксацию материала можно проводить лиофилизацией или горячим 96%-ным этанолом.Предварительное удаление пигментов, кислоторастворимого и липидного фосфора является непременным условием спектрофотометрического определения фосфора РНК и ДНК.
Ход работы
Для определения содержания нуклеиновых кислот навеску исследуемого материала (5 - 7 г) помещают в широкую пробирку и заливают 10-15 мл 0,5 и. НСЮ4, охлажденной до 0°С. Пробирку с навеской помещают в криогидратную смесь для фиксации. После фиксации навеску с НСЮ4 переносят в фарфоровую ступу, тщательно растирают стеклянным песком до гомогенного состояния и прокачивают на ротаторе 30 минут при пониженной температуре. Полученный гомогенат центрифугируют в течение 5 минут при 3000 об/мин. Экстракт сливают и ставят в холодильник. Осадок заливают 10 мл 0,5 и. НСЮ4 и прокачивают еще 30 минут при 0°С, а затем центрифугируют при тех же условиях. Экстракты объединяют в мерной колбе или цилиндре, а осадок трижды промывают холодной дистиллированной водой. Промывные воды объединяют с кислотными экстрактами, немедленно нейтрализуют 0,2 и. NaOH по фенолфталеину и доводят до определенного объема. Образующиеся хлопья натриевой соли хлорной кислоты удаляют центрифугированием. Нейтрализованный хлорнокислый экстракт может быть использован для определения свободных адениловых нуклеотидов.
Остаток после удаления кислоторастворимого фосфора трижды обрабатывают 96%-ным этанолом на холоде. Затем проводят многократную экстракцию смесью этанол-серный эфир (3:1) при комнатной температуре до полного извлечения пигментов.
Последний раз остаток промывают эфиром и высушивают в вакуум-эксикаторе. Подготовленная таким образом растительная масса используется для определения нуклеиновых кислот.Остаток после извлечения кислоторастворимого и липидного фосфора заливают 0,5 и. КОН (или NaOH) из расчета 10 мл щелочи на 100 мг остатка и выдерживают при 37° С в течение часа. Затем охлаждают и центрифугируют 15 минут при 4000 об/мин. Надосадочную жидкость сливают и ставят в холодильник, а осадок после промывания холодным 0,5 и. КОН отбрасывают. Прозрачные центрифугаты объединяют и нейтрализуют на ледяной бане холодной 57%-ной НСЮ4 по фенолфталеину. Затем концентрацию раствора этой кислоты доводят до 5% ее содержания. На холоде выпадает осадок ДНК, а в растворе остается РНК. Через 20 минут осадок отделяют центрифугированием и два раза (по 5 мл) промывают охлажденной 5%-ной НСЮ4. Центрифугаты, содержащие РНК, объединяют в конической колбочке на 50 мл, закрывают обратным воздушным холодильником и гидролизуют на кипящей водяной бане в течение 15 минут. Затем охлаждают и фильтруют через стеклянный фильтр №4 или через обеззоленный “мелкопористый” фильтр. Объем прозрачного фильтрата измеряют и используют для спектрофотометрического определения фосфора РНК.
Осадок ДНК с помощью 5%-ной HCIO4 переносят в коническую колбочку на 50 мл, закрывают обратным воздушным холодильником и гидролизуют 30 минут на кипящей водяной бане. После охлаждения и центрифугирования жидкость сливают в мерную колбочку, а осадок промывают небольшим количеством 5%-ной НСЮ4, центрифугируют и надосадочную жидкость присоединяют к первому центрифугату, объем доводят до метки или просто измеряют. Прозрачный раствор спектрофотометрируют. В качестве контроля, против которого измеряют оптическую плотность опытного раствора, берут 5%-ный раствор НСЮ4. Оптическую плотность полученных опытных растворов измеряют при 270 и 290 нм.
Вычисление концентрации фосфора нуклеиновых кислот (2Q производят по формуле:
х=Е27О~Е29омг/
190
где Е - оптическая плотность растворов при соответствующей длине волны. Деление на 190 дает количество фосфора нуклеиновой кислоты в 1 мл раствора.
Пример расчета
При спектрофотометрировании раствора РНК найдена Е27о = 836, а Е29о = 506. Объем раствора РНК составлял 100 мл. Перед определением оптиче-
ской плотности он был разбавлен в 3 раза. Навеска растительного материала в пересчете на сухой вес 0,5 г. Количество фосфора РНК будет:
Литература
1. Окунцов М.М.,. Боровик З.И., Гребенников А.С. и др. Специальный практикум по биохимии и физиологии растений. Калининград, 1981. С.8-10.