Подбор праймеров для работы с образцами ДНК малины и ежевики

На следующем этапе необходимо было провести подбор праймеров для работы с образцами ДНК малины и ежевики. В исследование было включено 40 RAPD-праймеров (см. раздел Методы): 10, 180.01, 270.01, 270.09, 280.02, 360.04, 370.02, 370.09, 480.04, D, Е, H, I, J, Opal, Opa2, OpalO, Opall, Opal2, 0pal4, Opal6, Opal7, Opal9, Oρb9, Opc2, Opcl4, Opcl5, Opel4, 0pq9, 0pr2, Pl 16, Р131, P153, RothA20, Rubl, Rub2, Rub3, Rub4, Vavl, Vav2.

16 из этих TMPD-праймеров не дало амплификационных продуктов ни с ДНК малины, ни с ДНК ежевики, и таким образом оказалась непригодно для дальнейшего анализа.

Только 24 7МР£>-праймера генерировали амплификационные фрагменты у изученных сортов малин и ежевик. Из них 8 /?ЛРСМіраймеров были способны амплифицировать ДНК как малин, так и ежевик. Амплификационные продукты с ДНК малин дали следующие RAPD-праймеры: RothA20, Rubl, Rub2, Rub4, 10, 270.01, 280.02, 370.02, 370,09, 480.04, P153, OpalO, Opall, Opal2, Opal4, Орс2, Opc 14, Opq9, Opr2. C ДНК ежевик генерировали амплификационные фрагменты следующие праймеры: 270.01, 280.02, 370.02, 370.09, 480,04, P131, P153, OpalO, Opal2, Opal4, 0pb9, Opcl5, Opel4, 0pr2, Opq9 (табл. III). Результаты RAPD анализа воспроизводились в повторном эксперименте.

3.3.3.