СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ 6
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Структурно-функциональная организация генома растений
1.1. Уникальные последовательности генома растений
1.2. Характеристика основных семейств генов растительного генома
1.2. L Семейство генов устойчивости растений
L 2.2. Семейство MADS-box генов 26
1.2.3. Семейство генов протеинкиназ растений
1.3. Повторяющиеся последовательности генома растений ^ ^
39
44
55
1.3.1. Фракция высокоповторяющейся ДНК
1.3.2. Фракция умеренно-повторяющейся ДНК: гены рРНК и их
спейсерные участки
1.3.3. Фракция умеренно-повторяющейся ДНК: мобильные элементы
генома растений
1.4. Молекулярные методы анализа растительного генома
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 62
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 81
3.1. Анализ геномного полиморфизма представителей трех
родов сем. Solanaceae 81
3.1.1. Молекулярное маркирование генома методами AFLP-, RAPD- и ISSR
анализа, выявление уровней геномного полиморфизма и определение
филогенетических связей у видов и сортов рода Solanum L 32
3.1.1.1. Анализ межвидового и внутри видового полиморфизма
представителей рода Solanum методом AFLP g2
3.1.1.2. Анализ межвидового и внутривидового полиморфизма
представителей рода Solanum методом RAPD 85
3.1.1.4. Анализ генома представителей рода Solanum методом
ISSR маркирования межмикросателлитных ^
последовательностей
3.1.1.5. Определение филогенетических отношений представителей
рода Solanum
3.1.1.6. Выявление межсортового полиморфизма у представителей
Solanum: AFLP-, RAPD- и ISSR-маркирование сортов
картофеля (S. tuberosum) и RAPD анализ сортов баклажана (S.
melongena)
3.1.1.7. Молекулярный анализ фрагментов RAPD-спекгра генома
картофеля
3.1.1.7. Влияние одиночной замены в праймере на
перекрываемость спектров RAPD- фрагментов
3.1.7.2. Анализ молекулярной природы полученных RAPD
фрагментов
ЗЛ.2. Молекулярное маркирование генома методами RAPD-, AFLP- и
ISSR-анализа, выявление уровней геномного полиморфизма и
определение филогенетических связей у видов, разновидностей и сортов рода
Lycopersicon (Tourn.)Mill.
3.1.2.1.Определения генетического полиморфизма и филогенетических
связей у представителей рода Lycopersicon методом RAPD
3.1.2.2. RAPD-анализ сортов культивируемого томата Lycopersicon
esculentum
3.1.2.3.Определение генетического полиморфизма и филогенетических
связей у представителей рода Lycopersicon. методом ISSR
3.1.2.4. Определение генетического полиморфизма и филогенетических
связей у представителей рода Lycopersicon методом AFLP
3.1.2.5. Таксономические и филогенетические взаимоотношения у
дикорастущих и культивируемых видов Lycopersicon, выявляемые
при использовании RAPD-, AFLP- и ISSR- маркирования генома
3.1.3. Молекулярное маркирование генома RAPD-, AFLP- и ISSR- методами и
определение филогенетических связей у видов, разновидностей и сортов рода
Capsicum L.
3.1.3.1. Анализ межвидового полиморфизма видов и сортов рода
Capsicum методом AFLP
3.1.3.2. Анализ внутривидового полиморфизма у Capsicum,
выявляемого методом AFLP
3.1.3.3. Использование AFLP-системы молекулярного маркирования
для определения филогении видов рода Capsicum.
3.1.3.4. Анализ генома видов и сортов рода Capsicum RAPD-методом
3.1.3.5. RAPD-анализ межвидового и внутривидового полиморфизма
и определение филогении рода Capsicum
3.1.3.6. Анализ генома видов и сортов рода Capsicum методом ISSR-
маркирования межмикросателлитных последовательностей
3.1.3.7. ISSR-анализ межвидового и внутривидового полиморфизма и
определение филогении видов рода Capsicum
3.1.3.8. Использование систем молекулярного маркирования для
определения таксономически спорных образцов
генетических коллекций Capsicum
3.1.3.9. Комплексный анализ генетического разнообразия видов
Capsicum chinense и Capsicum frutescens с использованием
AFLP-, RAPD-, ISSR- систем молекулярного маркирования
3.1.3.10. Комплексный анализ генома рода Capsicum с
использованием AFLP-, RAPD- и ISSR-систем
молекулярного маркирования.
3.2. Молекулярный анализ основных адаптивно значимых семейств
генов (генов резистентности, MADS-box генов и генов, кодирующих
протеинкиназы) у представителей сем. Solanaceae
3.2Л. Разработка метода DDP-маркирования генома.
3.2.1.1. NBS-маркирование семейства генов резистентности (R-генов
и RGAs)
3.2.1.2. MADS- маркирование семейства гомеозисных генов и РК-
маркирование семейства генов серин-треониновых
протеинкиназ.
3.2.2. Молекулярный анализ семейства генов резистентности у
представителей рода Solanum
3.2.2.1. Определение полиморфизма семейства генов резистентности у
445 сортов картофеля европейской и отечественной селекции
3.2.3. Молекулярный анализ семейства генов резистентности у
представителей рода Capsicum
3.2.3.1. Общая характеристика полиморфизма RGA-фрагментов видов
перца, выявленного при использовании метода NBS-
маркирования
3.2.3.2. Использование метода NBS-маркирования для определения
филогении RGA-семейства последовательностей у Capsicum
3.2.3.3. Анализ нуклеотидных последовательностей полиморфных
RGA-фраі ментов генома Capsicum
3*2.4. Молекулярный анализ семейства MADS-box генов и их аналогов у
представителей рода Capsicum
3.2.4.1. Использование метода MADS-маркирования для определения
филогении семейства MADS-содержащих последовательностей
генома Capsicum
3.2.5. Молекулярный анализ семейства генов, кодирующих серин-
треониновые протеинкиназы у представителей рода Capsicum
3.2.5.1. Анализ нуклеотидных последовательностей полиморфных РК-
фрагментов
3.3. Разработка метода TAIL PCR для маркирования фланкирующих
геномных последовательностей при транспозон-опосредованном AcDs
инсерционном мутагенезе
3.3.1. Использование метода TAIL PCR для анализа эмбрио-дефектной
летальной мутации, вызванной инсерцией мобильного элемента |
